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Ce n'est pas farfelue. Le séquençage du génome a déjà trouvé sa place dans l'école secondaire et les programmes de premier cycle en biologie. Le programme phages Hunters financé HHMI donne étudiants et élèves du secondaire l'occasion de découvrir de nouveaux mycobactériophages un groupe de virus qui infectent les bactéries dans leurs sols locaux. Les génomes viraux sont de petite taille, et donc pas cher de renvoyer à séquencer. De plus, il est amusant de nommer les nouveaux phages vous découvrez (la tradition est quirkiness, avec des noms comme Corndog, Citrouille, et banjo), et vous pouvez comparer le génome de votre phage à d'autres dans la base de données.

Génomes Cheaper devrait améliorer l'éducation de premier cycle

En vérité, nous sommes, paraît-il, sur le point de franchir le seuil de 1000 $ par génome humain. Voilà ce que la filiale Life Technologies Ion Torrent réclame de son nouveau système Ion Proton et Personal Genome Machine1. Illumina et 454 les plates-formes reposent sur des systèmes optiques pour détecter quand une base particulière a été constituée, qui dit Life Technologies augmente le coût. Les nouvelles machines moins chères contournent l'optique à l'aide de minuscules capteurs de pH pour détecter les ions + H libérés quand un nucléotide est incorporé.

séquençage du niveau de la population est non seulement utilisé dans le domaine. Il est partie intégrante d'une nouvelle vague de projets d'évolution expérimentale. Nous pouvons déjà déguster un flacon de diviser la levure à intervalles réguliers, la séquence toute la levure dans l'échantillon, et la fréquence des gènes de tracé au Canada Goose Homme Annecy fil du temps. En raison de l'énorme quantité de levure ou de bactéries dans un flacon, l'espace des mutations possibles peut être échantillonné dans une plus grande mesure que dans les modèles animaux. Il y a un nombre énorme de questions qui peuvent être traitées par des expériences de premier cycle. Quelle est la stabilité de cet élément génomique? Que puis-je faire pour le déstabiliser? Quels types de mutations peuvent produire phénotype X, et à quelle fréquence se produire-ils? Quel est le taux de mutation dans cette nouvelle espèce ou souche? En sélectionnant pour trait Y, puis-je choisir par inadvertance à d'autres traits?

Ces sortes de questions sont parfaits pour les enquêtes de premier cycle. Evolution et de la génomique à la fois englobent un large éventail de sujets et de techniques, et il y a une grande variété dans le nombre d'approches qui peuvent être prises. Cela permet et encourage les instructeurs à développer des cours de laboratoire d'enquête sur la base, où les étudiants peuvent répondre à leurs propres questions nouvelles avec la recherche fondamentale.

Maintenant, imaginez être capable de séquencer les bactéries dans le même échantillon de sol. Cela augmente le niveau de sophistication de façon spectaculaire, ce qui permet aux étudiants de comprendre l'écologie microbienne de leurs sols locaux. Si les bactéries ont été cultivées à l'avance, il serait également permettre aux étudiants d'aller plus loin dans l'étude d'un (nouvellement découverte, même) organisme nouvellement séquencé.

Certaines choses dans la science sont juste intrinsèquement coûteux. Creuser kilomètres de longs tunnels remplis de vide et de supraconducteurs haute aimants seront toujours hors de la portée des scientifiques amateurs et les universités de même. Mais certaines technologies commencent apparaissant intrinsèquement coûteux et déprécient rapidement, au point de devenir largement disponibles. Les premiers ordinateurs étaient énormes machines qui nécessitaient une équipe de personnel, mais maintenant beaucoup d'entre nous porter un autour dans notre poche. séquençage de l'ADN doit tout d'abord avoir l'air d'une technologie intrinsèquement coûteux, mais aujourd'hui, il ne pouvait pas être plus clair que le séquençage de l'ADN est beaucoup plus comme l'informatique que la physique des hautes énergies. Le coût du séquençage d'un génome humain a chuté à un rythme effarant au cours de la dernière décennie (il suffit de regarder le graphique). En fait, le taux d'innovation dans la communauté de séquençage de l'ADN dépasse largement la loi de Moore. Si le séquençage de l'ADN n'a pas suivi la loi de Moore, avec le coût du séquençage d'un génome réduit de moitié tous les 18 mois, le séquençage d'un génome humain serait aujourd'hui coûter encore des millions.

Les implications de cette coupe dans les coûts sont énormes. De toute évidence, cela signifie que pratiquement tout le monde peut avoir son génome séquencé pour informer leurs soins médicaux. Tout aussi important est le coup de pouce à la science fondamentale qui en résultera. Si un génome humain peut être séquencé pour 1000 $, puis plus petits génomes peuvent être séquencés pour encore moins. En tant que premier cycle, je suis excité par la possibilité que le séquençage du génome pourrait bientôt trouver son chemin dans le curriculum de la biologie et de laboratoires de recherche de premier cycle. Si bon marché, séquenceurs d'ADN deviennent une réalité tous les laboratoires de premier cycle sera en mesure d'avoir un. L'achat d'une machine nécessite encore un investissement initial important, mais que les prix baissent de séquenceurs d'ADN pourrait devenir comparable au prix d'autres instruments déjà utilisés dans les laboratoires de premier cycle.

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